手帳の申請はいつされてますか？
28年度の10月と言う事ですか？

例えばですか、28年度12月に申請して交付日が1/26になってしまった。
この場合はそれを証明するものがあれば確定申告出来ます。
障害者控除を受けれます。
ただ、28年度中に申請してました！をアピールして下さいね！

この間まさに同じ件で役所と税務署を2往復した所です！

2度？2級？自治体によって呼び名は違うと思いますが、特別障がい児なら療育手帳で子供と同居なら75万の控除のはずです。

税務署でもお住いの市税事務所に問い合わせられるのが1番間違いないと思います。