自閉症の息子2人の母親です。実は私自身も発達障がいを抱えています。8年間適応障がいと診断され入退院を繰り返したのですが昨年11月から障害者雇用で病院で看護助手の仕事についています。常識とマナーに気をつけていたつもりでした。が、今日上司にコミュニケーションのクレームがあり、見当がつかなくて戸惑っています。無自覚のうちに何かやらかしているようです。このままでは4月に契約継続してもらえないかと心配です。いつもいつの間にも孤立するという経験をしています。こんな私で何かアドバイスしていただけませんか？

日々努力の積み重ね。ほんとうにお疲れ様です。

上司に「客からクレームあったわ…」と喚起されたとのことですが、上司がその仔細を把握していないのですから、たぶん、そのクレームは些細なものだったのでしょう。あまり自分を追い詰めないでくださいね。
契約継続にかんしてですが、障碍者雇用ですし、病院は常に人手不足に思い悩まされているでしょうから、そう簡単にクビになる事はないと思います。
障碍者雇用なのであなたのサポート役が存在すると思われますが、その方に、いま抱えている不安を打ち明けてはいかがでしょうか？　気が付いたら孤立無援の状況に立っていた、という原因を探ってくれるかもしれないですし、あなたに合った助言を与えてくれると思います。
さて、無自覚のうちに何かやらかしている、ということですが、あなたは具体的にそれを想像できますか？
それらを箇条書きでまとめて、それらしい対策を練る。これが現時点であなたがとれる最善の策かもしれません。
いま私が書けるものはこのくらいでしょうか？
またなにかあったら質問してください。誰かしら相談にのってくれるでしょうから。
では乱文しつれいしました。