この春中２になった末っ子次男が２月末から学校に行けなくなりました。
全校集会で粗相をしてしまい、周りの目が怖くなってしまったのが原因です。
元々、幼稚園の頃から行き渋りがあり、学校に行かない事への抵抗感はないようなので、余計に行きたがらないのかもしれません。
発達グレイゾーンな事もあり、精神科への通院もしていますが、担当医は「行きたくないよね。無理にいかなくていいよ。」
それもわかりますが、クラスも替わるこの時期に最初から行けないのはこのまま不登校まっしぐらな気がして、不安です。
去年の末頃から起立性調節障害も患い、朝気分が悪いこともよくあります。
いろいろ重なっててて、本人も不安だろうとは思いますが、
子供の気持ちがほぐれるのをただ待つべきなのか、それとも多少強引にでも学校に(相談室に)連れてって先生や気にかけてくれるクラスメイトと交流させた方がいいのか、どうしたらいいのでしょうか？

子どもの気持ちがほぐれるのをただ待つというよりは

子どもの気持ちがほぐれるよう配慮をする。
そして、頑張れそうなら、背中をそっと押す。でしょうか？

粗相とは、いわゆる粗相でよいと思いますが、これは原因はなんですか？
原因によっては、病気だからとかきちんと理解させて、場合によっては暗示をかけてあげ、学校に理解や強力してもらうもあると思います。

怖くないよ！と励ますのではなく
絶対確実に間違いなしに怖い。だけど、このまま家にとじこもってても怖さは払拭されない。という現実をわかってるか？ということが大事だと思いますね。

そういう現実をわかって動けないのか、わかってすらないのか？で対応は違うと思います。

本人の気持ちを受け止めることは、何もかも飲み込んであげることとは違うので
否定せずに聞くけど、必要に応じて修正するでいくのがよいと思います。

二月末に事件は起きていて、まだ時間がたってません。６月ぐらいに、別室へのお試し登校ができたらよいのでは？

学校にいかないにしても、勉強はしろ。とか、それも嫌なら家事をさせてください。
できそうなことはさせる。
学校は無理でも、家庭や地域で社会参加させるなど、引きこもらせない方法はありますよ。

早寝早起き朝ごはん。という生活リズムをきちんと整えること。これが学校へ戻るや、勉強より最重要課題だと思います。